Перезагрузка Кикайдера

События фильма разворачиваются в ближайшем будущем в Японии. Робототехник Нобухико Комёдзи создает робота Кикайдера в рамках проекта «Ковчег». После загадочной смерти Нобухико, Кикайдер обнаруживает, что проект отклонился от своей миссии. Он решает бороться с «Ковчегом» и восстановить справедливость.