Сфиральная топология как принцип прямого геометрического свития белковых цепей

Сфиральная топология как принцип прямого геометрического свития белковых цепей © О.С. Басаргин Аннотация В статье представлен подход к описанию белковых структур на основе сфиральной топологии — топологического принципа, задающего чередование фаз свития и развёртывания с зеркальной антисимметрией. Генетическая последовательность интерпретируется как ритмическая программа пространственного формирования, а не как статистический источник вероятностей. Координатная реализация выполняется через вращательную координатную модель (сферический способ вычисления координат), выступающую исключительно как вычислительный инструмент пространственной реализации. Топологическая организация структуры при этом полностью определяется сфиральным принципом и не сводится к сферической геометрии. Подход позволяет получать пространственную структуру напрямую из кодирующей последовательности без обучения и перебора конфигураций. Вводятся понятия S-петель, полярности свития, ритма структуры и вектора ошибки замыкания. Показано, что интервалы между S-петлями демонстрируют фрактальные свойства и приближение к золотому сечению. Ключевые слова #декодирование