Protein-Sfiral

Введение: кризис вычислительной биологии Одной из главных проблем современной биологии остается "Проблема фолдинга" (Levinthal¶dox). Полипептидная цепь может свернуться в миллиарды различных конфигураций, но в природе она мгновенно находит единственно верную форму. Существующие решения имеют два недостатка: 1.   Вычислительная сложность: требуются суперкомпьютеры и огромные энергозатраты для расчета взаимодействия всех атомов. 2.   Эффект "Черного ящика": нейросети вроде Transformer предсказывают результат, но не объясняют физику процесса самоорганизации материи. Модуль Protein-Sfiral предлагает смену парадигмы: переход от перебора вариантов к геометрическому детерминизму на основе теории Сфирали (О.С. Басаргин).