Гомологичный фолдинг белков, Павел Яковлев BIOCAD

Выступление Павла Яковлева в рамках Летней школы по биоинформатике, 2017 В современной структурной биологии есть ряд вычислительных методов, позволяющих с высокой достоверностью характеризовать биологические молекулы, их схожесть и различия, способы взаимодействия и функции. Для построения подобных вычислений входным параметром всегда выступает пространственная структура белка, однако её получение не смотря на полувековой прогресс в области кристаллографии может быть затруднен. Лекция посвящена решению этой проблемы с помощью гомологичного моделирования структур белков — построения трехмерных структур из фрагментов схожих. Для примера будут рассмотрены вариабельные домены антител — белков, обладающих уникальным структурным разнообразием вариабельных петель.