Шайтан К.В. Топография ультрамногомерных энергетических ландшафтов и экстремальные принципы ...

Топография ультрамногомерных энергетических ландшафтов и экстремальные принципы динамики линейных биополимеров в вязких средах Шайтан К.В. МГУ имени М.В. Ломоносова, Москва, Россия ФИЦ ИХФ им. Н.Н.Семенова РАН, Москва, Россия Линейные биополимеры (белки, ДНК, РНК и др.) являются молекулярной основой функционирования живых систем. Эти структуры отличает весьма организованное динамическое поведение, наличие коллективных и внутренне согласованных степеней свободы. В ряде случаев используют даже термин "молекулярные машины". Физические основы столь "умного" динамического поведения являются предметом дискуссий, до конца не ясны и бросают определенный вызов современному естествознанию. На данный момент накоплено большое количество данных о пространственных структурах и динамическом поведении конкретных биомолекулярных структур при их функционировании. Задача состоит в выявлении фундаментальных принципов, лежащих в основе обсуждаемых явлений. Это совершенно необходимо для дальнейшего развития современной инженерной и синтетической биологии, понимания физических принципов, лежащих в основе возникновения жизни. Необходимо отметить, что обычно применяемые подходы к такого рода задачам оказались не очень эффективными. Компьютерное моделирование траекторий молекулярной динамики биополимеров полезны как источник новых данных о динамике конкретных биомолекулярных систем. Но без четкой постановки физической задачи для численного эксперимента и контроля точности вычислений такой подход...